选取合适的菌种
益生菌生产的第一步是选择合适的菌种。菌种应该具有以下几个特征：能够存活在酸性环境中，能够抵抗胆盐，在人体内有益，容易在大规模生产中培养。
经过反复试验和筛选，生产厂商会选择具有这些特征的菌种作为生产原料。这些菌种会被保存在特定的培养基中，以保证它们的生长和繁殖。
培养菌种
选定菌种后，生产商会将它们培养到足够数量，以便后续的扩大生产。通常，菌种会在封闭的发酵罐中生长，环境温度和湿度都会被严格控制。每个批次的生产过程可能需要进行数天或数周。
在培养的过程中，生产商会对生长过程进行监测和控制。这些措施包括监测发酵罐内的pH值和温度。如果必要，厂商还会添加营养物质来促进生长，从而增加产量和菌落的活力。
收获并处理
一旦菌落达到预定的数量和活性水平，生产商会停止培养过程。收获的菌落可以进行多种处理包括水洗、离心、冷冻或冷冻干燥等，以便更好地用于后续的生产过程。这些步骤确保益生菌具有良好的品质和适当的活性水平。
制备益生菌制品
接下来，生产商会将菌落混合到特定的营养物质中。这些物质会助长的繁殖并提高产量。此时，制备的混合物经过密闭发酵罐内的几轮生长扩增，会在特定的温度下不断分裂繁殖。这种方式的过程更为复杂，需要经验丰富的技术人员去操作。
包装和保存
一旦益生菌制品生产完成，生产商会将产品包装到特殊的容器中。包装材料必须具有保护性，保护菌落免受外界污染或其他有害物质的影响。后，生产商会将益生菌制品存放在恰当的温度下。如果不妥善保存，可能会失去活性，产品的质量就会降低。
质量控制
益生菌制品的生产是需要经过严格的质量控制的。生产商会对每个批次的产品进行检测和测试，以确认其活性水平和菌落的数量。这些测试可确保生产的益生菌产品符合相关的质量标准并确保其安全性。
大部分生产过程都是机器化的，但是生产厂商需要注意到产品的质量和活性并确定好适当的营养物质。在确认产品质量过后，制定好包装和储存的方案，从而确保生产出的益生菌制品具有大的功效。